Según responsables del museo, la remodelación ha permitido incorporar los más modernos conocimientos museológicos y museográficos, creando un museo conceptual que integra al visitante y potencia la figura del coleccionista como hilo conductor en la presentaciónde su propia colección.

El museo, formado por las colecciones que José Lázaro Galdiano (1862-1947) donó al Estado español, está considerado una de las pinacotecas más importantes de Europa, tercera de Madrid en lo que a pintura española respecta.

Destacan la colección de primitivos y el Gabinete Goya. La singularidad de José Lázaro Galdiano le llevo a reunir también una importante muestra de pinturas de la Escuela Holandesa e Inglesa, auténtica curiosidad en la historia del coleccionismo español. Lo amplio y ecléctico de la colección, con una cronología que va desde el siglo VII a.C. hasta el siglo XX, permite una secuencia expositiva global donde las pinturas expuestas son apoyadas por esculturas y artes suntuarias del mismo periodo o escuela.